А.Ф. Рогалёв в газете «Мінская праўда» за 18 августа 2001 г. сообщает, что река Вилия — главный приток Немана — имеет несколько притоков, из которых два носят названия Вилейка — буквально «маленькая Вилия». От одной такой речки и получил своё название здешний город. Другая Вилейка впадает в Вилию на территории нынешней Литвы и на слиянии этих двух рек в своё время был основан город Вильня.